300 ปีหลังจากสงครามครั้งใหญ่ระหว่างโลกและดาวอังคารซึ่งสงครามครั้งนั้นเรียกว่า “Calamity War สงครามหายนะ” ผู้หญิงนามว่า Cordelia ได้เดินทางมายังโลกและได้พูดถึงอิสระภาพในเมือง Martian แห่ง Chryse (ชื่อเกาะเล็กในทะเล Aegean ของตำนานกรีก ) ซึ่งอยู่ภายใต้การควบคุมของรัฐบาลโลก เธอมาพร้อมกับผู้คุ้มกันของเธอซึ่งเป็นพนักงานของบริษัทรักษาความปลอดภัย CGS ชื่อ Mikazuki Augus และ Orga Itsuka เมื่อได้มีกลุ่มชื่อ Gjallarhorn โจมตี CGS กับ Cordelia, Orga ที่เห็นเป็นโอกาสที่จะก่อกบฏกับ CGS และทำการรัฐประหาร Mikazuki และ Orgaได้ถูกนำพาไปสู่ความขัดแย้งครั้งใหม่ เพื่อขับไล่ Gjallarhorn ไป Mikazuki ได้ขึ้นขับ mobile suit โบราณจาก Calamity War (สงครามหายนะ) ซึ่งใช้พลังงาน nuclear reactor (ปฏิกรณ์นิวเคลียร์)