แขนกลคนแปรธาตุ เดอะ มูฟวี่ พิชิตแดนปริศนาฝ่านครที่ถูกลืม - ณ เรือนจำกลางของเซ็นทรัล เมืองหลวงของ อาเมสทริส “เมลวิน วอยเจอร์” นักโทษที่ได้แหกคุกมาทั้งที่เขาใกล้จะพ้นโทษอยู่แล้ว เอ็ดและอัลได้เห็นวิชาแปลกประหลาดที่เขาใช้จึงเกิดความสนใจขึ้นมาทันทีสองพี่น้องจึงได้ตามรอยเขาซึ่งมุ่งหน้าไปชายแดนติดกับอณาจักร เครต้าทางด้านตะวันตกของอาเมสทริส และในพวกเขาก็เดินทางมาถึงเมือง เทเบิ้ลซิตี้ ที่ล้อมรอบด้วยหุ้มเหวใหญ่ซึ่งเคยเป็นอาณาจักร มิลอส มาก่อน ที่นี่สองพี่น้องเอลริค ได้พบกับหญิงสาวคนหนึ่ง เธอมีชื่อว่า จูเลีย จากคำบอกเล่าของเธอทำให้ทั้งสองคนได้รู้ว่าที่เมืองแห่งนี้เคยมีประวัติศาสตร์ซุกซ่อนอยู่